Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
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