Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC20Q12834 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC20Q12834 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC20Q12834 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC20Q12834 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC20Q12834 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC20Q12834 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC20Q12834 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC20Q12834 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC20Q12834 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC20Q12834 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC20Q12834 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC20Q12834 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC20Q12834 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC20Q12834 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC20Q12834 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC20Q12834 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC20Q12834 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC20Q12834 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC20Q12834 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDC20Q12834 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms