Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNH2Q12809 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNH2Q12809 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNH2Q12809 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNH2Q12809 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNH2Q12809 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNH2Q12809 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNH2Q12809 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNH2Q12809 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNH2Q12809 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNH2Q12809 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNH2Q12809 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNH2Q12809 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNH2Q12809 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNH2Q12809 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNH2Q12809 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNH2Q12809 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNH2Q12809 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNH2Q12809 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms