Protein–RNA interactions for Protein: Q12798

CETN1, Centrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETN1Q12798 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CETN1Q12798 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CETN1Q12798 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms