Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOBRQ0VD83 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBRQ0VD83 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms