Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SYCNQ0VAF6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SYCNQ0VAF6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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