Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP4F3Q08477 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms