Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB2Q08289 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms