Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLEQ07864 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLEQ07864 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLEQ07864 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLEQ07864 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLEQ07864 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLEQ07864 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLEQ07864 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLEQ07864 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLEQ07864 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLEQ07864 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POLEQ07864 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLEQ07864 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLEQ07864 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLEQ07864 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLEQ07864 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLEQ07864 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLEQ07864 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLEQ07864 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLEQ07864 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLEQ07864 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLEQ07864 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLEQ07864 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLEQ07864 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLEQ07864 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLEQ07864 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLEQ07864 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLEQ07864 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLEQ07864 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLEQ07864 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLEQ07864 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLEQ07864 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLEQ07864 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLEQ07864 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLEQ07864 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLEQ07864 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLEQ07864 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLEQ07864 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLEQ07864 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLEQ07864 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLEQ07864 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLEQ07864 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLEQ07864 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLEQ07864 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLEQ07864 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLEQ07864 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLEQ07864 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLEQ07864 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLEQ07864 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLEQ07864 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLEQ07864 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLEQ07864 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLEQ07864 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLEQ07864 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLEQ07864 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLEQ07864 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLEQ07864 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLEQ07864 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLEQ07864 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLEQ07864 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLEQ07864 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLEQ07864 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLEQ07864 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLEQ07864 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLEQ07864 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLEQ07864 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLEQ07864 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLEQ07864 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLEQ07864 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLEQ07864 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLEQ07864 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLEQ07864 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLEQ07864 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLEQ07864 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLEQ07864 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLEQ07864 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLEQ07864 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLEQ07864 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLEQ07864 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLEQ07864 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLEQ07864 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLEQ07864 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLEQ07864 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLEQ07864 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLEQ07864 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLEQ07864 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLEQ07864 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLEQ07864 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLEQ07864 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLEQ07864 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLEQ07864 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLEQ07864 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLEQ07864 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLEQ07864 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLEQ07864 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLEQ07864 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLEQ07864 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLEQ07864 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLEQ07864 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
POLEQ07864 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms