Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CXCL9Q07325 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCL9Q07325 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms