Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms