Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TNP2Q05952 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms