Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALD1Q05682 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALD1Q05682 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms