Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP1Q04837 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms