Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RPL6Q02878 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL6Q02878 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.1 ms