Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms