Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCN7AQ01118 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCN7AQ01118 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms