Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
B4GALNT1Q00973 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
B4GALNT1Q00973 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
B4GALNT1Q00973 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
B4GALNT1Q00973 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
B4GALNT1Q00973 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
B4GALNT1Q00973 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
B4GALNT1Q00973 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4GALNT1Q00973 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms