Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUCB2P80303 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUCB2P80303 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms