Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P63132 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms