Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A1P60842 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4A1P60842 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.2 ms