Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP4P57796 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP4P57796 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP4P57796 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP4P57796 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP4P57796 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP4P57796 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP4P57796 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP4P57796 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP4P57796 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP4P57796 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP4P57796 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP4P57796 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP4P57796 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP4P57796 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CABP4P57796 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP4P57796 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP4P57796 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP4P57796 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP4P57796 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP4P57796 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP4P57796 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP4P57796 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP4P57796 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP4P57796 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP4P57796 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP4P57796 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP4P57796 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP4P57796 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP4P57796 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP4P57796 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP4P57796 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP4P57796 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP4P57796 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP4P57796 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP4P57796 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP4P57796 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP4P57796 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP4P57796 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP4P57796 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP4P57796 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP4P57796 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP4P57796 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP4P57796 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP4P57796 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP4P57796 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP4P57796 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP4P57796 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP4P57796 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP4P57796 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP4P57796 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP4P57796 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP4P57796 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP4P57796 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP4P57796 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP4P57796 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP4P57796 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP4P57796 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP4P57796 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP4P57796 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP4P57796 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP4P57796 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP4P57796 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP4P57796 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP4P57796 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP4P57796 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP4P57796 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP4P57796 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP4P57796 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP4P57796 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP4P57796 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP4P57796 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP4P57796 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP4P57796 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP4P57796 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP4P57796 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP4P57796 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP4P57796 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP4P57796 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP4P57796 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP4P57796 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP4P57796 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP4P57796 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP4P57796 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP4P57796 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP4P57796 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP4P57796 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP4P57796 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP4P57796 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP4P57796 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP4P57796 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP4P57796 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP4P57796 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP4P57796 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP4P57796 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP4P57796 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP4P57796 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP4P57796 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP4P57796 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP4P57796 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms