Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GSDMDP57764 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSDMDP57764 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms