Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FCGRTP55899 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FCGRTP55899 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms