Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BRPF1P55201 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms