Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LBX1P52954 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LBX1P52954 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LBX1P52954 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LBX1P52954 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LBX1P52954 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LBX1P52954 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LBX1P52954 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LBX1P52954 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LBX1P52954 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LBX1P52954 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LBX1P52954 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LBX1P52954 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LBX1P52954 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LBX1P52954 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LBX1P52954 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LBX1P52954 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LBX1P52954 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LBX1P52954 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LBX1P52954 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LBX1P52954 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LBX1P52954 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LBX1P52954 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LBX1P52954 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LBX1P52954 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LBX1P52954 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LBX1P52954 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LBX1P52954 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LBX1P52954 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LBX1P52954 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LBX1P52954 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LBX1P52954 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LBX1P52954 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LBX1P52954 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LBX1P52954 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LBX1P52954 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LBX1P52954 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LBX1P52954 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LBX1P52954 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LBX1P52954 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LBX1P52954 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LBX1P52954 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LBX1P52954 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LBX1P52954 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LBX1P52954 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LBX1P52954 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LBX1P52954 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LBX1P52954 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LBX1P52954 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LBX1P52954 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LBX1P52954 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LBX1P52954 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LBX1P52954 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LBX1P52954 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LBX1P52954 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LBX1P52954 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LBX1P52954 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LBX1P52954 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LBX1P52954 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LBX1P52954 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LBX1P52954 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LBX1P52954 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LBX1P52954 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LBX1P52954 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LBX1P52954 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LBX1P52954 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LBX1P52954 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LBX1P52954 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LBX1P52954 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LBX1P52954 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LBX1P52954 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LBX1P52954 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LBX1P52954 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LBX1P52954 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LBX1P52954 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LBX1P52954 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LBX1P52954 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBX1P52954 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBX1P52954 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBX1P52954 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBX1P52954 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBX1P52954 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBX1P52954 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBX1P52954 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBX1P52954 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBX1P52954 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBX1P52954 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBX1P52954 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LBX1P52954 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LBX1P52954 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBX1P52954 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBX1P52954 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBX1P52954 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBX1P52954 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBX1P52954 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBX1P52954 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBX1P52954 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBX1P52954 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBX1P52954 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBX1P52954 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms