Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NUP98P52948 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP98P52948 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP98P52948 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP98P52948 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP98P52948 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP98P52948 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP98P52948 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP98P52948 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP98P52948 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP98P52948 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP98P52948 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP98P52948 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP98P52948 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP98P52948 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP98P52948 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP98P52948 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP98P52948 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP98P52948 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP98P52948 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP98P52948 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP98P52948 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP98P52948 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP98P52948 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP98P52948 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP98P52948 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP98P52948 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP98P52948 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP98P52948 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP98P52948 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP98P52948 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP98P52948 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP98P52948 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP98P52948 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP98P52948 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP98P52948 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP98P52948 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP98P52948 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP98P52948 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP98P52948 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP98P52948 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP98P52948 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP98P52948 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP98P52948 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP98P52948 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP98P52948 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP98P52948 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP98P52948 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP98P52948 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP98P52948 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP98P52948 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP98P52948 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP98P52948 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP98P52948 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP98P52948 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP98P52948 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP98P52948 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP98P52948 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP98P52948 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP98P52948 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP98P52948 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP98P52948 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP98P52948 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP98P52948 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP98P52948 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP98P52948 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP98P52948 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP98P52948 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP98P52948 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP98P52948 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP98P52948 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP98P52948 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP98P52948 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP98P52948 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP98P52948 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP98P52948 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP98P52948 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP98P52948 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP98P52948 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP98P52948 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP98P52948 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP98P52948 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP98P52948 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP98P52948 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP98P52948 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP98P52948 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP98P52948 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP98P52948 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP98P52948 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP98P52948 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP98P52948 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP98P52948 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP98P52948 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP98P52948 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP98P52948 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP98P52948 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP98P52948 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP98P52948 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP98P52948 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP98P52948 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms