Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK4P51957 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK4P51957 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK4P51957 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK4P51957 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK4P51957 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK4P51957 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK4P51957 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK4P51957 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK4P51957 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK4P51957 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK4P51957 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK4P51957 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK4P51957 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK4P51957 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK4P51957 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK4P51957 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK4P51957 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK4P51957 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK4P51957 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK4P51957 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK4P51957 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK4P51957 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK4P51957 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK4P51957 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK4P51957 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK4P51957 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK4P51957 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK4P51957 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK4P51957 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK4P51957 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK4P51957 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK4P51957 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK4P51957 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEK4P51957 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEK4P51957 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEK4P51957 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEK4P51957 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK4P51957 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK4P51957 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK4P51957 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK4P51957 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK4P51957 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK4P51957 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK4P51957 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK4P51957 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK4P51957 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK4P51957 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK4P51957 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK4P51957 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK4P51957 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK4P51957 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK4P51957 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK4P51957 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK4P51957 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK4P51957 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK4P51957 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK4P51957 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK4P51957 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK4P51957 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK4P51957 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK4P51957 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK4P51957 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK4P51957 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK4P51957 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK4P51957 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK4P51957 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK4P51957 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK4P51957 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK4P51957 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK4P51957 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK4P51957 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK4P51957 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK4P51957 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK4P51957 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK4P51957 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK4P51957 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK4P51957 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK4P51957 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK4P51957 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK4P51957 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK4P51957 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK4P51957 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK4P51957 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK4P51957 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK4P51957 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK4P51957 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK4P51957 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK4P51957 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK4P51957 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK4P51957 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK4P51957 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK4P51957 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK4P51957 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK4P51957 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK4P51957 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK4P51957 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK4P51957 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK4P51957 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK4P51957 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms