Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRCA2P51587 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRCA2P51587 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms