Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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RAB5CP51148 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB5CP51148 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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RAB5CP51148 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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RAB5CP51148 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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RAB5CP51148 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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RAB5CP51148 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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RAB5CP51148 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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RAB5CP51148 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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