Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CRIP1P50238 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms