Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF6P49848 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF6P49848 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF6P49848 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF6P49848 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF6P49848 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF6P49848 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF6P49848 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF6P49848 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF6P49848 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF6P49848 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF6P49848 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF6P49848 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF6P49848 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF6P49848 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF6P49848 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF6P49848 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF6P49848 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF6P49848 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF6P49848 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF6P49848 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF6P49848 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF6P49848 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF6P49848 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF6P49848 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF6P49848 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF6P49848 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF6P49848 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF6P49848 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF6P49848 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF6P49848 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF6P49848 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF6P49848 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF6P49848 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF6P49848 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF6P49848 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF6P49848 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF6P49848 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF6P49848 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF6P49848 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF6P49848 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF6P49848 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF6P49848 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF6P49848 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF6P49848 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF6P49848 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF6P49848 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF6P49848 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF6P49848 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF6P49848 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF6P49848 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF6P49848 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF6P49848 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF6P49848 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF6P49848 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF6P49848 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF6P49848 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF6P49848 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF6P49848 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF6P49848 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF6P49848 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF6P49848 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF6P49848 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF6P49848 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF6P49848 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF6P49848 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF6P49848 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF6P49848 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF6P49848 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF6P49848 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF6P49848 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF6P49848 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF6P49848 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF6P49848 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF6P49848 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF6P49848 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF6P49848 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF6P49848 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF6P49848 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF6P49848 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF6P49848 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF6P49848 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF6P49848 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF6P49848 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF6P49848 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF6P49848 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF6P49848 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF6P49848 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF6P49848 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF6P49848 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF6P49848 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF6P49848 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF6P49848 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF6P49848 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF6P49848 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF6P49848 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF6P49848 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF6P49848 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF6P49848 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF6P49848 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms