Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms