Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSNK1EP49674 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms