Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NESP48681 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NESP48681 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NESP48681 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NESP48681 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NESP48681 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NESP48681 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NESP48681 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NESP48681 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NESP48681 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NESP48681 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NESP48681 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NESP48681 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NESP48681 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
NESP48681 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NESP48681 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NESP48681 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NESP48681 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NESP48681 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NESP48681 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NESP48681 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NESP48681 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NESP48681 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NESP48681 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NESP48681 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NESP48681 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NESP48681 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NESP48681 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NESP48681 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NESP48681 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NESP48681 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NESP48681 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NESP48681 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NESP48681 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NESP48681 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
NESP48681 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NESP48681 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
NESP48681 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
NESP48681 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NESP48681 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NESP48681 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NESP48681 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NESP48681 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NESP48681 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NESP48681 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NESP48681 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NESP48681 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NESP48681 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NESP48681 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NESP48681 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
NESP48681 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NESP48681 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
NESP48681 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NESP48681 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NESP48681 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
NESP48681 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
NESP48681 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
NESP48681 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NESP48681 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NESP48681 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
NESP48681 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NESP48681 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NESP48681 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
NESP48681 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NESP48681 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NESP48681 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NESP48681 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NESP48681 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
NESP48681 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NESP48681 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NESP48681 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NESP48681 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NESP48681 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
NESP48681 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NESP48681 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NESP48681 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NESP48681 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NESP48681 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NESP48681 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NESP48681 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NESP48681 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NESP48681 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NESP48681 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NESP48681 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NESP48681 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NESP48681 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
NESP48681 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NESP48681 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NESP48681 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NESP48681 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NESP48681 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NESP48681 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NESP48681 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NESP48681 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NESP48681 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NESP48681 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NESP48681 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NESP48681 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NESP48681 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NESP48681 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms