Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP5P45974 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP5P45974 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP5P45974 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP5P45974 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP5P45974 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP5P45974 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP5P45974 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP5P45974 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP5P45974 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP5P45974 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP5P45974 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP5P45974 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP5P45974 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP5P45974 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP5P45974 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP5P45974 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP5P45974 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP5P45974 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP5P45974 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP5P45974 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP5P45974 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP5P45974 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP5P45974 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP5P45974 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP5P45974 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP5P45974 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP5P45974 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP5P45974 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP5P45974 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP5P45974 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP5P45974 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP5P45974 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP5P45974 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP5P45974 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP5P45974 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP5P45974 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP5P45974 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP5P45974 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP5P45974 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP5P45974 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP5P45974 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP5P45974 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP5P45974 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP5P45974 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP5P45974 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP5P45974 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP5P45974 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP5P45974 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP5P45974 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP5P45974 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP5P45974 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP5P45974 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP5P45974 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP5P45974 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP5P45974 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP5P45974 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP5P45974 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP5P45974 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP5P45974 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP5P45974 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP5P45974 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP5P45974 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP5P45974 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP5P45974 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP5P45974 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP5P45974 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP5P45974 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP5P45974 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP5P45974 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP5P45974 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP5P45974 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP5P45974 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP5P45974 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP5P45974 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP5P45974 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms