Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MLH1P40692 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MLH1P40692 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MLH1P40692 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MLH1P40692 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MLH1P40692 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MLH1P40692 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MLH1P40692 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MLH1P40692 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MLH1P40692 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MLH1P40692 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MLH1P40692 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MLH1P40692 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MLH1P40692 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MLH1P40692 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
MLH1P40692 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MLH1P40692 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MLH1P40692 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MLH1P40692 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MLH1P40692 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MLH1P40692 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MLH1P40692 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MLH1P40692 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MLH1P40692 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MLH1P40692 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MLH1P40692 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MLH1P40692 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MLH1P40692 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MLH1P40692 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MLH1P40692 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MLH1P40692 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MLH1P40692 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MLH1P40692 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MLH1P40692 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
MLH1P40692 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MLH1P40692 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MLH1P40692 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MLH1P40692 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MLH1P40692 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MLH1P40692 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MLH1P40692 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MLH1P40692 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MLH1P40692 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MLH1P40692 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MLH1P40692 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MLH1P40692 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MLH1P40692 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MLH1P40692 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MLH1P40692 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MLH1P40692 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MLH1P40692 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MLH1P40692 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MLH1P40692 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MLH1P40692 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MLH1P40692 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MLH1P40692 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MLH1P40692 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MLH1P40692 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MLH1P40692 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MLH1P40692 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MLH1P40692 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MLH1P40692 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MLH1P40692 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MLH1P40692 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MLH1P40692 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MLH1P40692 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MLH1P40692 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MLH1P40692 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MLH1P40692 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MLH1P40692 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MLH1P40692 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MLH1P40692 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MLH1P40692 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MLH1P40692 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MLH1P40692 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MLH1P40692 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MLH1P40692 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MLH1P40692 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
MLH1P40692 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MLH1P40692 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MLH1P40692 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MLH1P40692 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MLH1P40692 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MLH1P40692 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MLH1P40692 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MLH1P40692 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MLH1P40692 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MLH1P40692 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MLH1P40692 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MLH1P40692 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MLH1P40692 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MLH1P40692 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MLH1P40692 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MLH1P40692 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MLH1P40692 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MLH1P40692 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MLH1P40692 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MLH1P40692 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MLH1P40692 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MLH1P40692 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms