Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACVR1BP36896 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACVR1BP36896 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms