Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN2P35609 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms