Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
ABCC1P33527 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms