Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms