Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA9P31269 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA9P31269 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA9P31269 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA9P31269 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA9P31269 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA9P31269 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA9P31269 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA9P31269 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA9P31269 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA9P31269 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA9P31269 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA9P31269 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA9P31269 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA9P31269 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA9P31269 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA9P31269 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA9P31269 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA9P31269 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA9P31269 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA9P31269 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXA9P31269 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms