Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms