Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB2P29033 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB2P29033 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB2P29033 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB2P29033 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB2P29033 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB2P29033 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB2P29033 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB2P29033 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB2P29033 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB2P29033 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB2P29033 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB2P29033 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB2P29033 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB2P29033 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB2P29033 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB2P29033 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB2P29033 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB2P29033 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB2P29033 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB2P29033 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB2P29033 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB2P29033 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GJB2P29033 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB2P29033 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB2P29033 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB2P29033 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB2P29033 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB2P29033 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB2P29033 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB2P29033 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB2P29033 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB2P29033 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB2P29033 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB2P29033 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB2P29033 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB2P29033 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB2P29033 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB2P29033 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB2P29033 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB2P29033 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB2P29033 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB2P29033 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB2P29033 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB2P29033 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB2P29033 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB2P29033 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB2P29033 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB2P29033 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB2P29033 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB2P29033 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB2P29033 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB2P29033 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB2P29033 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB2P29033 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB2P29033 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB2P29033 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB2P29033 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB2P29033 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB2P29033 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB2P29033 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB2P29033 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB2P29033 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB2P29033 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB2P29033 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB2P29033 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB2P29033 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB2P29033 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB2P29033 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB2P29033 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB2P29033 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB2P29033 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB2P29033 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms