Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms