Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX2P28328 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX2P28328 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX2P28328 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX2P28328 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX2P28328 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX2P28328 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX2P28328 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX2P28328 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX2P28328 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX2P28328 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX2P28328 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX2P28328 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX2P28328 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX2P28328 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX2P28328 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX2P28328 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX2P28328 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX2P28328 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX2P28328 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX2P28328 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX2P28328 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX2P28328 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX2P28328 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX2P28328 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX2P28328 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX2P28328 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX2P28328 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX2P28328 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX2P28328 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX2P28328 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX2P28328 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX2P28328 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX2P28328 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX2P28328 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX2P28328 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX2P28328 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX2P28328 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX2P28328 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX2P28328 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX2P28328 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX2P28328 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX2P28328 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX2P28328 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX2P28328 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX2P28328 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX2P28328 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX2P28328 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX2P28328 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX2P28328 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX2P28328 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX2P28328 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX2P28328 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX2P28328 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX2P28328 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX2P28328 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX2P28328 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX2P28328 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX2P28328 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX2P28328 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX2P28328 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX2P28328 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX2P28328 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX2P28328 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEX2P28328 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PEX2P28328 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PEX2P28328 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PEX2P28328 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PEX2P28328 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PEX2P28328 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX2P28328 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX2P28328 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX2P28328 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX2P28328 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX2P28328 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX2P28328 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX2P28328 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX2P28328 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX2P28328 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX2P28328 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX2P28328 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX2P28328 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX2P28328 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX2P28328 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX2P28328 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX2P28328 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX2P28328 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX2P28328 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX2P28328 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEX2P28328 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms