Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms