Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms