Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRDP23468 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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