Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MYF6P23409 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MYF6P23409 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYF6P23409 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYF6P23409 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYF6P23409 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYF6P23409 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYF6P23409 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYF6P23409 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYF6P23409 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYF6P23409 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYF6P23409 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYF6P23409 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYF6P23409 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYF6P23409 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MYF6P23409 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYF6P23409 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYF6P23409 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYF6P23409 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYF6P23409 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYF6P23409 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYF6P23409 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYF6P23409 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MYF6P23409 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MYF6P23409 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MYF6P23409 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYF6P23409 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYF6P23409 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYF6P23409 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYF6P23409 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYF6P23409 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYF6P23409 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MYF6P23409 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms